Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zscan5bB2RTN3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zscan5bB2RTN3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms