Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms