Protein–RNA interactions for Protein: B2RR83

Ythdc2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc2B2RR83 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ythdc2B2RR83 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ythdc2B2RR83 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ythdc2B2RR83 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ythdc2B2RR83 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ythdc2B2RR83 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ythdc2B2RR83 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ythdc2B2RR83 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ythdc2B2RR83 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ythdc2B2RR83 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ythdc2B2RR83 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ythdc2B2RR83 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ythdc2B2RR83 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ythdc2B2RR83 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ythdc2B2RR83 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ythdc2B2RR83 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ythdc2B2RR83 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ythdc2B2RR83 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ythdc2B2RR83 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ythdc2B2RR83 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ythdc2B2RR83 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ythdc2B2RR83 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ythdc2B2RR83 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ythdc2B2RR83 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ythdc2B2RR83 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ythdc2B2RR83 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ythdc2B2RR83 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ythdc2B2RR83 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ythdc2B2RR83 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ythdc2B2RR83 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ythdc2B2RR83 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ythdc2B2RR83 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ythdc2B2RR83 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ythdc2B2RR83 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ythdc2B2RR83 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ythdc2B2RR83 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ythdc2B2RR83 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ythdc2B2RR83 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ythdc2B2RR83 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ythdc2B2RR83 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ythdc2B2RR83 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ythdc2B2RR83 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ythdc2B2RR83 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ythdc2B2RR83 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ythdc2B2RR83 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ythdc2B2RR83 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ythdc2B2RR83 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ythdc2B2RR83 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ythdc2B2RR83 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ythdc2B2RR83 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ythdc2B2RR83 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ythdc2B2RR83 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ythdc2B2RR83 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ythdc2B2RR83 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ythdc2B2RR83 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ythdc2B2RR83 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ythdc2B2RR83 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ythdc2B2RR83 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ythdc2B2RR83 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ythdc2B2RR83 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ythdc2B2RR83 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ythdc2B2RR83 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ythdc2B2RR83 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ythdc2B2RR83 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ythdc2B2RR83 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ythdc2B2RR83 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ythdc2B2RR83 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ythdc2B2RR83 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ythdc2B2RR83 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ythdc2B2RR83 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ythdc2B2RR83 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ythdc2B2RR83 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ythdc2B2RR83 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ythdc2B2RR83 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ythdc2B2RR83 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ythdc2B2RR83 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ythdc2B2RR83 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ythdc2B2RR83 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ythdc2B2RR83 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ythdc2B2RR83 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ythdc2B2RR83 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ythdc2B2RR83 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ythdc2B2RR83 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ythdc2B2RR83 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ythdc2B2RR83 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ythdc2B2RR83 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ythdc2B2RR83 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ythdc2B2RR83 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ythdc2B2RR83 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ythdc2B2RR83 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ythdc2B2RR83 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ythdc2B2RR83 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ythdc2B2RR83 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ythdc2B2RR83 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ythdc2B2RR83 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ythdc2B2RR83 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ythdc2B2RR83 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ythdc2B2RR83 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ythdc2B2RR83 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ythdc2B2RR83 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms