Protein–RNA interactions for Protein: B1AZ99

Otud3, OTU domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud3B1AZ99 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud3B1AZ99 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud3B1AZ99 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud3B1AZ99 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud3B1AZ99 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud3B1AZ99 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud3B1AZ99 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud3B1AZ99 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud3B1AZ99 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud3B1AZ99 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud3B1AZ99 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud3B1AZ99 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud3B1AZ99 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud3B1AZ99 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud3B1AZ99 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud3B1AZ99 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud3B1AZ99 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud3B1AZ99 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud3B1AZ99 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud3B1AZ99 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud3B1AZ99 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud3B1AZ99 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud3B1AZ99 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud3B1AZ99 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud3B1AZ99 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud3B1AZ99 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud3B1AZ99 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud3B1AZ99 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud3B1AZ99 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud3B1AZ99 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud3B1AZ99 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud3B1AZ99 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud3B1AZ99 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud3B1AZ99 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud3B1AZ99 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud3B1AZ99 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud3B1AZ99 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud3B1AZ99 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud3B1AZ99 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud3B1AZ99 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud3B1AZ99 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud3B1AZ99 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud3B1AZ99 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud3B1AZ99 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud3B1AZ99 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud3B1AZ99 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud3B1AZ99 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud3B1AZ99 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud3B1AZ99 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud3B1AZ99 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud3B1AZ99 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud3B1AZ99 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud3B1AZ99 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud3B1AZ99 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud3B1AZ99 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud3B1AZ99 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud3B1AZ99 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud3B1AZ99 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud3B1AZ99 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud3B1AZ99 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud3B1AZ99 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud3B1AZ99 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud3B1AZ99 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud3B1AZ99 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud3B1AZ99 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud3B1AZ99 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud3B1AZ99 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud3B1AZ99 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud3B1AZ99 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud3B1AZ99 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud3B1AZ99 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud3B1AZ99 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud3B1AZ99 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud3B1AZ99 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud3B1AZ99 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud3B1AZ99 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud3B1AZ99 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud3B1AZ99 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud3B1AZ99 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud3B1AZ99 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud3B1AZ99 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud3B1AZ99 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud3B1AZ99 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud3B1AZ99 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud3B1AZ99 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud3B1AZ99 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud3B1AZ99 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud3B1AZ99 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud3B1AZ99 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud3B1AZ99 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud3B1AZ99 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud3B1AZ99 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud3B1AZ99 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud3B1AZ99 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud3B1AZ99 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud3B1AZ99 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud3B1AZ99 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud3B1AZ99 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud3B1AZ99 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud3B1AZ99 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms