Protein–RNA interactions for Protein: B1AYB6

Mbd5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd5B1AYB6 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mbd5B1AYB6 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mbd5B1AYB6 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mbd5B1AYB6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mbd5B1AYB6 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mbd5B1AYB6 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mbd5B1AYB6 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mbd5B1AYB6 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mbd5B1AYB6 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mbd5B1AYB6 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Mbd5B1AYB6 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Mbd5B1AYB6 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mbd5B1AYB6 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mbd5B1AYB6 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mbd5B1AYB6 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mbd5B1AYB6 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mbd5B1AYB6 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mbd5B1AYB6 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Mbd5B1AYB6 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mbd5B1AYB6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mbd5B1AYB6 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mbd5B1AYB6 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mbd5B1AYB6 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mbd5B1AYB6 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mbd5B1AYB6 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mbd5B1AYB6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mbd5B1AYB6 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mbd5B1AYB6 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mbd5B1AYB6 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mbd5B1AYB6 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mbd5B1AYB6 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mbd5B1AYB6 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mbd5B1AYB6 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mbd5B1AYB6 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Mbd5B1AYB6 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mbd5B1AYB6 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mbd5B1AYB6 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mbd5B1AYB6 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mbd5B1AYB6 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mbd5B1AYB6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Mbd5B1AYB6 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mbd5B1AYB6 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mbd5B1AYB6 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mbd5B1AYB6 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mbd5B1AYB6 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mbd5B1AYB6 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mbd5B1AYB6 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mbd5B1AYB6 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Mbd5B1AYB6 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mbd5B1AYB6 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mbd5B1AYB6 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Mbd5B1AYB6 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mbd5B1AYB6 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mbd5B1AYB6 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mbd5B1AYB6 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Mbd5B1AYB6 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mbd5B1AYB6 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mbd5B1AYB6 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mbd5B1AYB6 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mbd5B1AYB6 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mbd5B1AYB6 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Mbd5B1AYB6 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Mbd5B1AYB6 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mbd5B1AYB6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mbd5B1AYB6 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mbd5B1AYB6 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mbd5B1AYB6 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mbd5B1AYB6 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mbd5B1AYB6 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mbd5B1AYB6 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mbd5B1AYB6 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mbd5B1AYB6 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mbd5B1AYB6 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mbd5B1AYB6 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mbd5B1AYB6 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mbd5B1AYB6 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mbd5B1AYB6 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mbd5B1AYB6 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mbd5B1AYB6 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mbd5B1AYB6 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mbd5B1AYB6 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mbd5B1AYB6 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mbd5B1AYB6 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mbd5B1AYB6 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mbd5B1AYB6 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mbd5B1AYB6 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mbd5B1AYB6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mbd5B1AYB6 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mbd5B1AYB6 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Mbd5B1AYB6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mbd5B1AYB6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mbd5B1AYB6 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mbd5B1AYB6 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mbd5B1AYB6 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mbd5B1AYB6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mbd5B1AYB6 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mbd5B1AYB6 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mbd5B1AYB6 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mbd5B1AYB6 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mbd5B1AYB6 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms