Protein–RNA interactions for Protein: B1AW18

4930402K13Rik, MCG54973, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930402K13RikB1AW18 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930402K13RikB1AW18 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms