Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9F4

Ttll11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll11A4Q9F4 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms