Protein–RNA interactions for Protein: A2J008

Trgv2, MCG146472 (Fragment), mousemouse

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trgv2A2J008 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trgv2A2J008 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trgv2A2J008 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trgv2A2J008 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trgv2A2J008 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trgv2A2J008 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trgv2A2J008 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trgv2A2J008 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trgv2A2J008 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trgv2A2J008 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trgv2A2J008 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trgv2A2J008 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trgv2A2J008 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trgv2A2J008 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trgv2A2J008 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trgv2A2J008 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Trgv2A2J008 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Trgv2A2J008 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trgv2A2J008 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trgv2A2J008 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trgv2A2J008 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trgv2A2J008 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trgv2A2J008 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trgv2A2J008 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trgv2A2J008 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trgv2A2J008 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trgv2A2J008 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trgv2A2J008 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trgv2A2J008 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trgv2A2J008 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trgv2A2J008 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trgv2A2J008 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trgv2A2J008 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trgv2A2J008 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trgv2A2J008 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Trgv2A2J008 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trgv2A2J008 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Trgv2A2J008 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Trgv2A2J008 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Trgv2A2J008 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trgv2A2J008 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Trgv2A2J008 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Trgv2A2J008 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trgv2A2J008 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trgv2A2J008 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trgv2A2J008 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trgv2A2J008 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trgv2A2J008 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trgv2A2J008 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Trgv2A2J008 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Trgv2A2J008 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trgv2A2J008 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Trgv2A2J008 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trgv2A2J008 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trgv2A2J008 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trgv2A2J008 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Trgv2A2J008 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Trgv2A2J008 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trgv2A2J008 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trgv2A2J008 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trgv2A2J008 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trgv2A2J008 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trgv2A2J008 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trgv2A2J008 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trgv2A2J008 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trgv2A2J008 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trgv2A2J008 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trgv2A2J008 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trgv2A2J008 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trgv2A2J008 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trgv2A2J008 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trgv2A2J008 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trgv2A2J008 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trgv2A2J008 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trgv2A2J008 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Trgv2A2J008 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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