Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms