Protein–RNA interactions for Protein: A2AKX3

Setx, Probable helicase senataxin, mousemouse

Predictions only

Length 2,646 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SetxA2AKX3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SetxA2AKX3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SetxA2AKX3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SetxA2AKX3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SetxA2AKX3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SetxA2AKX3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SetxA2AKX3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SetxA2AKX3 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SetxA2AKX3 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SetxA2AKX3 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SetxA2AKX3 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SetxA2AKX3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SetxA2AKX3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SetxA2AKX3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SetxA2AKX3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SetxA2AKX3 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SetxA2AKX3 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SetxA2AKX3 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SetxA2AKX3 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SetxA2AKX3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SetxA2AKX3 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SetxA2AKX3 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SetxA2AKX3 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SetxA2AKX3 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SetxA2AKX3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SetxA2AKX3 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SetxA2AKX3 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SetxA2AKX3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SetxA2AKX3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SetxA2AKX3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SetxA2AKX3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SetxA2AKX3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SetxA2AKX3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SetxA2AKX3 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SetxA2AKX3 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SetxA2AKX3 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SetxA2AKX3 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SetxA2AKX3 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SetxA2AKX3 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SetxA2AKX3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SetxA2AKX3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SetxA2AKX3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SetxA2AKX3 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SetxA2AKX3 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SetxA2AKX3 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SetxA2AKX3 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SetxA2AKX3 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SetxA2AKX3 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SetxA2AKX3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SetxA2AKX3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SetxA2AKX3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SetxA2AKX3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SetxA2AKX3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SetxA2AKX3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SetxA2AKX3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SetxA2AKX3 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SetxA2AKX3 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SetxA2AKX3 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SetxA2AKX3 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SetxA2AKX3 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SetxA2AKX3 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SetxA2AKX3 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SetxA2AKX3 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SetxA2AKX3 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SetxA2AKX3 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SetxA2AKX3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SetxA2AKX3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SetxA2AKX3 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SetxA2AKX3 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SetxA2AKX3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SetxA2AKX3 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SetxA2AKX3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SetxA2AKX3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SetxA2AKX3 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SetxA2AKX3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SetxA2AKX3 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SetxA2AKX3 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SetxA2AKX3 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SetxA2AKX3 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SetxA2AKX3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SetxA2AKX3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SetxA2AKX3 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SetxA2AKX3 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SetxA2AKX3 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SetxA2AKX3 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SetxA2AKX3 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SetxA2AKX3 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SetxA2AKX3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SetxA2AKX3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SetxA2AKX3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SetxA2AKX3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SetxA2AKX3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SetxA2AKX3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SetxA2AKX3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SetxA2AKX3 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SetxA2AKX3 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SetxA2AKX3 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SetxA2AKX3 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SetxA2AKX3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SetxA2AKX3 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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