Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Frmpd1A2AKB4 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Frmpd1A2AKB4 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Frmpd1A2AKB4 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Frmpd1A2AKB4 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Frmpd1A2AKB4 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Frmpd1A2AKB4 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Frmpd1A2AKB4 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Frmpd1A2AKB4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Frmpd1A2AKB4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Frmpd1A2AKB4 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Frmpd1A2AKB4 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Frmpd1A2AKB4 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Frmpd1A2AKB4 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Frmpd1A2AKB4 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Frmpd1A2AKB4 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Frmpd1A2AKB4 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Frmpd1A2AKB4 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Frmpd1A2AKB4 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Frmpd1A2AKB4 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Frmpd1A2AKB4 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Frmpd1A2AKB4 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Frmpd1A2AKB4 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Frmpd1A2AKB4 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Frmpd1A2AKB4 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Frmpd1A2AKB4 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Frmpd1A2AKB4 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Frmpd1A2AKB4 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Frmpd1A2AKB4 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Frmpd1A2AKB4 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Frmpd1A2AKB4 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Frmpd1A2AKB4 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Frmpd1A2AKB4 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Frmpd1A2AKB4 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Frmpd1A2AKB4 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Frmpd1A2AKB4 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Frmpd1A2AKB4 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Frmpd1A2AKB4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Frmpd1A2AKB4 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Frmpd1A2AKB4 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Frmpd1A2AKB4 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Frmpd1A2AKB4 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Frmpd1A2AKB4 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Frmpd1A2AKB4 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Frmpd1A2AKB4 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Frmpd1A2AKB4 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Frmpd1A2AKB4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Frmpd1A2AKB4 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Frmpd1A2AKB4 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Frmpd1A2AKB4 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Frmpd1A2AKB4 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC27■■□□□ 1.91
Frmpd1A2AKB4 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Frmpd1A2AKB4 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Frmpd1A2AKB4 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Frmpd1A2AKB4 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Frmpd1A2AKB4 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Frmpd1A2AKB4 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Frmpd1A2AKB4 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Frmpd1A2AKB4 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Frmpd1A2AKB4 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Frmpd1A2AKB4 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Frmpd1A2AKB4 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Frmpd1A2AKB4 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Frmpd1A2AKB4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Frmpd1A2AKB4 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Frmpd1A2AKB4 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Frmpd1A2AKB4 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Frmpd1A2AKB4 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Frmpd1A2AKB4 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Frmpd1A2AKB4 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Frmpd1A2AKB4 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Frmpd1A2AKB4 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Frmpd1A2AKB4 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Frmpd1A2AKB4 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Frmpd1A2AKB4 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Frmpd1A2AKB4 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Frmpd1A2AKB4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Frmpd1A2AKB4 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Frmpd1A2AKB4 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Frmpd1A2AKB4 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Frmpd1A2AKB4 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Frmpd1A2AKB4 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Frmpd1A2AKB4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Frmpd1A2AKB4 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Frmpd1A2AKB4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Frmpd1A2AKB4 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Frmpd1A2AKB4 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Frmpd1A2AKB4 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Frmpd1A2AKB4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Frmpd1A2AKB4 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Frmpd1A2AKB4 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Frmpd1A2AKB4 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Frmpd1A2AKB4 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Frmpd1A2AKB4 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Frmpd1A2AKB4 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Frmpd1A2AKB4 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Frmpd1A2AKB4 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Frmpd1A2AKB4 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Frmpd1A2AKB4 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Frmpd1A2AKB4 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms