Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lcn6A2AJB9 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lcn6A2AJB9 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lcn6A2AJB9 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lcn6A2AJB9 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lcn6A2AJB9 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lcn6A2AJB9 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lcn6A2AJB9 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lcn6A2AJB9 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lcn6A2AJB9 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lcn6A2AJB9 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Lcn6A2AJB9 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lcn6A2AJB9 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lcn6A2AJB9 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lcn6A2AJB9 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lcn6A2AJB9 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lcn6A2AJB9 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lcn6A2AJB9 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Lcn6A2AJB9 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lcn6A2AJB9 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lcn6A2AJB9 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lcn6A2AJB9 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lcn6A2AJB9 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lcn6A2AJB9 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Lcn6A2AJB9 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lcn6A2AJB9 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lcn6A2AJB9 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lcn6A2AJB9 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lcn6A2AJB9 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lcn6A2AJB9 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lcn6A2AJB9 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lcn6A2AJB9 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
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Lcn6A2AJB9 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lcn6A2AJB9 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lcn6A2AJB9 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lcn6A2AJB9 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Lcn6A2AJB9 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lcn6A2AJB9 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Lcn6A2AJB9 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lcn6A2AJB9 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lcn6A2AJB9 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lcn6A2AJB9 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Lcn6A2AJB9 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Lcn6A2AJB9 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lcn6A2AJB9 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lcn6A2AJB9 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Lcn6A2AJB9 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Lcn6A2AJB9 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Lcn6A2AJB9 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lcn6A2AJB9 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lcn6A2AJB9 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Lcn6A2AJB9 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lcn6A2AJB9 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lcn6A2AJB9 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lcn6A2AJB9 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lcn6A2AJB9 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Lcn6A2AJB9 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lcn6A2AJB9 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lcn6A2AJB9 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lcn6A2AJB9 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lcn6A2AJB9 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lcn6A2AJB9 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms