Protein–RNA interactions for Protein: A2AJA7

Mamdc4, Apical endosomal glycoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 1,228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mamdc4A2AJA7 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms