Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc163A2AGD7 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc163A2AGD7 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc163A2AGD7 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc163A2AGD7 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc163A2AGD7 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Ccdc163A2AGD7 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Ccdc163A2AGD7 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc163A2AGD7 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms