Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rbbp8nlA2ABX0 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms