Protein–RNA interactions for Protein: A2AB62

1700023F06Rik, RIKEN cDNA 1700023F06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700023F06RikA2AB62 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms