Protein–RNA interactions for Protein: A2A7F4

Rlf, MCG122876, mousemouse

Predictions only

Length 1,918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RlfA2A7F4 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RlfA2A7F4 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RlfA2A7F4 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RlfA2A7F4 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RlfA2A7F4 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RlfA2A7F4 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RlfA2A7F4 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RlfA2A7F4 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RlfA2A7F4 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RlfA2A7F4 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RlfA2A7F4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RlfA2A7F4 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RlfA2A7F4 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RlfA2A7F4 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RlfA2A7F4 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RlfA2A7F4 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RlfA2A7F4 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RlfA2A7F4 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RlfA2A7F4 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RlfA2A7F4 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RlfA2A7F4 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RlfA2A7F4 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RlfA2A7F4 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RlfA2A7F4 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RlfA2A7F4 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RlfA2A7F4 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RlfA2A7F4 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RlfA2A7F4 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RlfA2A7F4 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RlfA2A7F4 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RlfA2A7F4 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RlfA2A7F4 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RlfA2A7F4 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RlfA2A7F4 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RlfA2A7F4 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RlfA2A7F4 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RlfA2A7F4 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RlfA2A7F4 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RlfA2A7F4 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RlfA2A7F4 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RlfA2A7F4 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RlfA2A7F4 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RlfA2A7F4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RlfA2A7F4 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RlfA2A7F4 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RlfA2A7F4 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RlfA2A7F4 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RlfA2A7F4 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RlfA2A7F4 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RlfA2A7F4 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RlfA2A7F4 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RlfA2A7F4 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RlfA2A7F4 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
RlfA2A7F4 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RlfA2A7F4 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RlfA2A7F4 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RlfA2A7F4 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RlfA2A7F4 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RlfA2A7F4 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RlfA2A7F4 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RlfA2A7F4 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RlfA2A7F4 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RlfA2A7F4 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RlfA2A7F4 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RlfA2A7F4 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RlfA2A7F4 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RlfA2A7F4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RlfA2A7F4 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RlfA2A7F4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RlfA2A7F4 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RlfA2A7F4 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RlfA2A7F4 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RlfA2A7F4 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RlfA2A7F4 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RlfA2A7F4 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RlfA2A7F4 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RlfA2A7F4 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RlfA2A7F4 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RlfA2A7F4 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RlfA2A7F4 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RlfA2A7F4 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RlfA2A7F4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RlfA2A7F4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RlfA2A7F4 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RlfA2A7F4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RlfA2A7F4 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RlfA2A7F4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RlfA2A7F4 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RlfA2A7F4 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RlfA2A7F4 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms