Protein–RNA interactions for Protein: A2A259

Pkd2l1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l1A2A259 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms