Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.87□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PRPF4BQ13523 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PRPF4BQ13523 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
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