Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 snoU109.3-201ENST00000459477 145 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 AC013244.3-201ENST00000605614 388 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 PPP2R2A-224ENST00000640787 318 ntTSL 5 BASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 LINC00871-202ENST00000556071 554 ntTSL 3 BASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
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PTPRDP23468 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
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PTPRDP23468 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC0.03□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
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PTPRDP23468 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.03□□□□□ -2.4
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PTPRDP23468 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
PTPRDP23468 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
PTPRDP23468 EEF1A1P39-201ENST00000440791 250 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
PTPRDP23468 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
PTPRDP23468 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC0.03□□□□□ -2.41
PTPRDP23468 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
PTPRDP23468 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
PTPRDP23468 XIRP2-AS1-201ENST00000525330 776 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.41
PTPRDP23468 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC0.03□□□□□ -2.41
PTPRDP23468 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.41
PTPRDP23468 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
PTPRDP23468 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
PTPRDP23468 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
PTPRDP23468 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
PTPRDP23468 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
PTPRDP23468 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
PTPRDP23468 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PTPRDP23468 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PTPRDP23468 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC0.02□□□□□ -2.41
PTPRDP23468 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PTPRDP23468 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC0.02□□□□□ -2.41
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