Protein–RNA interactions for Protein: Q14684

RRP1B, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1BQ14684 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.9
RRP1BQ14684 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RRP1BQ14684 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RRP1BQ14684 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RRP1BQ14684 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RRP1BQ14684 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RRP1BQ14684 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RRP1BQ14684 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RRP1BQ14684 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RRP1BQ14684 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RRP1BQ14684 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RRP1BQ14684 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RRP1BQ14684 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RRP1BQ14684 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RRP1BQ14684 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RRP1BQ14684 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
RRP1BQ14684 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
RRP1BQ14684 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RRP1BQ14684 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
RRP1BQ14684 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
RRP1BQ14684 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RRP1BQ14684 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RRP1BQ14684 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RRP1BQ14684 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RRP1BQ14684 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RRP1BQ14684 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RRP1BQ14684 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RRP1BQ14684 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
RRP1BQ14684 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
RRP1BQ14684 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RRP1BQ14684 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RRP1BQ14684 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RRP1BQ14684 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
RRP1BQ14684 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RRP1BQ14684 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
RRP1BQ14684 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RRP1BQ14684 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RRP1BQ14684 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
RRP1BQ14684 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
RRP1BQ14684 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
RRP1BQ14684 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
RRP1BQ14684 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
RRP1BQ14684 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
RRP1BQ14684 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
RRP1BQ14684 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RRP1BQ14684 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RRP1BQ14684 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RRP1BQ14684 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RRP1BQ14684 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
RRP1BQ14684 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RRP1BQ14684 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RRP1BQ14684 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RRP1BQ14684 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RRP1BQ14684 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RRP1BQ14684 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RRP1BQ14684 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RRP1BQ14684 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
RRP1BQ14684 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RRP1BQ14684 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RRP1BQ14684 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RRP1BQ14684 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RRP1BQ14684 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RRP1BQ14684 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RRP1BQ14684 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC3.14□□□□□ -1.91
RRP1BQ14684 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RRP1BQ14684 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RRP1BQ14684 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RRP1BQ14684 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RRP1BQ14684 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC3.13□□□□□ -1.91
RRP1BQ14684 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
RRP1BQ14684 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
RRP1BQ14684 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.8 ms