Protein–RNA interactions for Protein: Q14444

CAPRIN1, Caprin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN1Q14444 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 254.1 ms