Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
ZFHX3Q15911 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ZFHX3Q15911 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
ZFHX3Q15911 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ZFHX3Q15911 AL603865.2-201ENST00000401679 213 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ZFHX3Q15911 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ZFHX3Q15911 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ZFHX3Q15911 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ZFHX3Q15911 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
ZFHX3Q15911 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ZFHX3Q15911 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ZFHX3Q15911 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ZFHX3Q15911 RNU6-10P-201ENST00000384036 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ZFHX3Q15911 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ZFHX3Q15911 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ZFHX3Q15911 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
ZFHX3Q15911 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ZFHX3Q15911 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ZFHX3Q15911 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ZFHX3Q15911 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ZFHX3Q15911 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ZFHX3Q15911 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
ZFHX3Q15911 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ZFHX3Q15911 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ZFHX3Q15911 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
ZFHX3Q15911 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
ZFHX3Q15911 LINC02358-201ENST00000514413 465 ntTSL 5 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
ZFHX3Q15911 AC112206.4-201ENST00000515142 405 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ZFHX3Q15911 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
ZFHX3Q15911 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ZFHX3Q15911 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ZFHX3Q15911 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ZFHX3Q15911 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ZFHX3Q15911 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ZFHX3Q15911 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ZFHX3Q15911 ART2BP-201ENST00000453501 499 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ZFHX3Q15911 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ZFHX3Q15911 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ZFHX3Q15911 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ZFHX3Q15911 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
ZFHX3Q15911 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ZFHX3Q15911 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ZFHX3Q15911 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ZFHX3Q15911 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ZFHX3Q15911 HGF-207ENST00000453018 721 ntTSL 3 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
ZFHX3Q15911 AC091860.1-201ENST00000505723 432 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ZFHX3Q15911 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ZFHX3Q15911 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ZFHX3Q15911 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ZFHX3Q15911 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC-0.27□□□□□ -2.45
ZFHX3Q15911 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ZFHX3Q15911 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ZFHX3Q15911 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ZFHX3Q15911 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ZFHX3Q15911 MTND4P24-201ENST00000424002 397 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ZFHX3Q15911 BX119904.4-201ENST00000424402 301 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ZFHX3Q15911 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ZFHX3Q15911 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ZFHX3Q15911 RNA5SP461-201ENST00000516451 104 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ZFHX3Q15911 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ZFHX3Q15911 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC-0.27□□□□□ -2.45
ZFHX3Q15911 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ZFHX3Q15911 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
ZFHX3Q15911 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ZFHX3Q15911 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ZFHX3Q15911 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ZFHX3Q15911 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ZFHX3Q15911 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ZFHX3Q15911 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ZFHX3Q15911 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ZFHX3Q15911 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ZFHX3Q15911 MIR4324-201ENST00000584846 72 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ZFHX3Q15911 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ZFHX3Q15911 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ZFHX3Q15911 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
ZFHX3Q15911 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
ZFHX3Q15911 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ZFHX3Q15911 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
ZFHX3Q15911 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
ZFHX3Q15911 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
ZFHX3Q15911 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ZFHX3Q15911 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ZFHX3Q15911 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
ZFHX3Q15911 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ZFHX3Q15911 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ZFHX3Q15911 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC-0.28□□□□□ -2.45
ZFHX3Q15911 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ZFHX3Q15911 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ZFHX3Q15911 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ZFHX3Q15911 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
ZFHX3Q15911 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ZFHX3Q15911 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
ZFHX3Q15911 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ZFHX3Q15911 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ZFHX3Q15911 MIR6738-201ENST00000619620 64 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ZFHX3Q15911 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ZFHX3Q15911 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ZFHX3Q15911 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
ZFHX3Q15911 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
ZFHX3Q15911 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.6 ms