Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 AC091132.5-204ENST00000586348 630 ntTSL 3 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 AC007527.2-201ENST00000621825 546 ntTSL 5 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 OR5T3-202ENST00000313033 969 ntAPPRIS P1 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 RNU6-226P-201ENST00000363778 107 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 HSFY7P-201ENST00000432672 318 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 HSFY8P-201ENST00000437934 318 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 HSFY5P-201ENST00000453726 309 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 LINC01851-201ENST00000443419 637 ntTSL 3 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 AC009032.1-201ENST00000617574 431 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 RNA5SP86-201ENST00000390869 98 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 AC092170.1-201ENST00000440211 356 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 TRBV8-1-201ENST00000481590 279 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 AC027449.1-201ENST00000608890 407 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 TXNL1P1-201ENST00000429528 554 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 BTBD7P2-201ENST00000441962 620 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 TSPAN19-204ENST00000532498 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 MIR4263-201ENST00000584745 83 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 AC005021.1-201ENST00000608730 355 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC-0.32□□□□□ -2.46
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