Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ME3Q16798 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ME3Q16798 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
ME3Q16798 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
ME3Q16798 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ME3Q16798 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ME3Q16798 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ME3Q16798 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ME3Q16798 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ME3Q16798 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ME3Q16798 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
ME3Q16798 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
ME3Q16798 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
ME3Q16798 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
ME3Q16798 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
ME3Q16798 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
ME3Q16798 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ME3Q16798 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ME3Q16798 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ME3Q16798 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ME3Q16798 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ME3Q16798 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ME3Q16798 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ME3Q16798 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
ME3Q16798 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
ME3Q16798 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
ME3Q16798 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
ME3Q16798 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ME3Q16798 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ME3Q16798 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ME3Q16798 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ME3Q16798 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ME3Q16798 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ME3Q16798 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ME3Q16798 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ME3Q16798 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ME3Q16798 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
ME3Q16798 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
ME3Q16798 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
ME3Q16798 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
ME3Q16798 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ME3Q16798 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ME3Q16798 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ME3Q16798 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
ME3Q16798 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ME3Q16798 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
ME3Q16798 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ME3Q16798 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ME3Q16798 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ME3Q16798 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ME3Q16798 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
ME3Q16798 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ME3Q16798 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ME3Q16798 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ME3Q16798 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ME3Q16798 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ME3Q16798 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ME3Q16798 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ME3Q16798 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ME3Q16798 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
ME3Q16798 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ME3Q16798 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ME3Q16798 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ME3Q16798 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
ME3Q16798 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
ME3Q16798 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
ME3Q16798 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
ME3Q16798 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
ME3Q16798 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
ME3Q16798 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ME3Q16798 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ME3Q16798 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
ME3Q16798 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
ME3Q16798 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
ME3Q16798 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
ME3Q16798 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ME3Q16798 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ME3Q16798 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ME3Q16798 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
ME3Q16798 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
ME3Q16798 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ME3Q16798 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
ME3Q16798 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ME3Q16798 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
ME3Q16798 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ME3Q16798 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ME3Q16798 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ME3Q16798 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ME3Q16798 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ME3Q16798 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ME3Q16798 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ME3Q16798 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ME3Q16798 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
ME3Q16798 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ME3Q16798 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
ME3Q16798 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ME3Q16798 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ME3Q16798 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
ME3Q16798 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ME3Q16798 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103 ms