Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVS0

C1orf140, Putative uncharacterized protein C1orf140, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf140Q5VVS0 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
C1orf140Q5VVS0 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC0.28□□□□□ -2.36
C1orf140Q5VVS0 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
C1orf140Q5VVS0 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC0.28□□□□□ -2.36
C1orf140Q5VVS0 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
C1orf140Q5VVS0 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC0.28□□□□□ -2.36
C1orf140Q5VVS0 AL353148.1-203ENST00000452286 665 ntTSL 3 BASIC0.28□□□□□ -2.36
C1orf140Q5VVS0 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
C1orf140Q5VVS0 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
C1orf140Q5VVS0 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC0.28□□□□□ -2.36
C1orf140Q5VVS0 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
C1orf140Q5VVS0 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
C1orf140Q5VVS0 AL606834.3-201ENST00000602615 496 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
C1orf140Q5VVS0 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
C1orf140Q5VVS0 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
C1orf140Q5VVS0 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
C1orf140Q5VVS0 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
C1orf140Q5VVS0 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
C1orf140Q5VVS0 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
C1orf140Q5VVS0 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
C1orf140Q5VVS0 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
C1orf140Q5VVS0 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC0.27□□□□□ -2.37
C1orf140Q5VVS0 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC0.27□□□□□ -2.37
C1orf140Q5VVS0 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
C1orf140Q5VVS0 LINC02066-201ENST00000492731 580 ntTSL 4 BASIC0.27□□□□□ -2.37
C1orf140Q5VVS0 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
C1orf140Q5VVS0 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
C1orf140Q5VVS0 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
C1orf140Q5VVS0 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC0.27□□□□□ -2.37
C1orf140Q5VVS0 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
C1orf140Q5VVS0 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC0.27□□□□□ -2.37
C1orf140Q5VVS0 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC0.27□□□□□ -2.37
C1orf140Q5VVS0 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
C1orf140Q5VVS0 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
C1orf140Q5VVS0 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
C1orf140Q5VVS0 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
C1orf140Q5VVS0 AL512427.1-201ENST00000618593 349 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
C1orf140Q5VVS0 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
C1orf140Q5VVS0 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
C1orf140Q5VVS0 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
C1orf140Q5VVS0 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
C1orf140Q5VVS0 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
C1orf140Q5VVS0 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
C1orf140Q5VVS0 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
C1orf140Q5VVS0 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
C1orf140Q5VVS0 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC0.26□□□□□ -2.37
C1orf140Q5VVS0 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC0.26□□□□□ -2.37
C1orf140Q5VVS0 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
C1orf140Q5VVS0 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
C1orf140Q5VVS0 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
C1orf140Q5VVS0 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
C1orf140Q5VVS0 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
C1orf140Q5VVS0 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
C1orf140Q5VVS0 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC0.26□□□□□ -2.37
C1orf140Q5VVS0 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
C1orf140Q5VVS0 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
C1orf140Q5VVS0 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
C1orf140Q5VVS0 MTND4LP25-201ENST00000570218 163 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
C1orf140Q5VVS0 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
C1orf140Q5VVS0 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
C1orf140Q5VVS0 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
C1orf140Q5VVS0 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
C1orf140Q5VVS0 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
C1orf140Q5VVS0 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
C1orf140Q5VVS0 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
C1orf140Q5VVS0 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC0.25□□□□□ -2.37
C1orf140Q5VVS0 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC0.25□□□□□ -2.37
C1orf140Q5VVS0 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
C1orf140Q5VVS0 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
C1orf140Q5VVS0 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
C1orf140Q5VVS0 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
C1orf140Q5VVS0 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
C1orf140Q5VVS0 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
C1orf140Q5VVS0 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
C1orf140Q5VVS0 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
C1orf140Q5VVS0 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
C1orf140Q5VVS0 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
C1orf140Q5VVS0 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
C1orf140Q5VVS0 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
C1orf140Q5VVS0 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
C1orf140Q5VVS0 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC0.25□□□□□ -2.37
C1orf140Q5VVS0 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
C1orf140Q5VVS0 AC007527.2-201ENST00000621825 546 ntTSL 5 BASIC0.25□□□□□ -2.37
C1orf140Q5VVS0 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
C1orf140Q5VVS0 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
C1orf140Q5VVS0 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
C1orf140Q5VVS0 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
C1orf140Q5VVS0 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
C1orf140Q5VVS0 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
C1orf140Q5VVS0 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
C1orf140Q5VVS0 AC104982.1-201ENST00000478775 574 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
C1orf140Q5VVS0 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
C1orf140Q5VVS0 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
C1orf140Q5VVS0 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
C1orf140Q5VVS0 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC0.24□□□□□ -2.37
C1orf140Q5VVS0 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
C1orf140Q5VVS0 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
C1orf140Q5VVS0 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.24□□□□□ -2.37
C1orf140Q5VVS0 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
C1orf140Q5VVS0 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 159 ms