Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SYCP1Q15431 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SYCP1Q15431 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 AC018645.2-201ENST00000609151 472 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.9□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC0.88□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 LINC02465-202ENST00000508724 503 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC0.87□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.87□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC0.86□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 MIR4509-3-201ENST00000578671 94 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 MIR4509-2-201ENST00000583920 94 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 AL158050.2-201ENST00000605336 568 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 MIR4509-1-201ENST00000618224 94 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SYCP1Q15431 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.6 ms