Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC2.04□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC2.04□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC2.03□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
KNOP1Q1ED39 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
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