Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, human

Predictions only

Length 1,872 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene	UniProt Accession	Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TAF1	P21675	MRPL42P6-201	ENST00000486397	371 nt	BASIC	2.57	□□□□□ -2
TAF1	P21675	AC063944.1-201	ENST00000496943	295 nt	TSL 3 BASIC	2.57	□□□□□ -2
TAF1	P21675	AC114801.2-201	ENST00000503825	781 nt	BASIC	2.57	□□□□□ -2
TAF1	P21675	Y_RNA.670-201	ENST00000516255	105 nt	BASIC	2.57	□□□□□ -2
TAF1	P21675	RNU4ATAC7P-201	ENST00000516280	125 nt	BASIC	2.57	□□□□□ -2
TAF1	P21675	Y_RNA.691-201	ENST00000516611	103 nt	BASIC	2.57	□□□□□ -2
TAF1	P21675	RNU6-1016P-201	ENST00000516689	94 nt	BASIC	2.57	□□□□□ -2
TAF1	P21675	IGHVII-53-1-201	ENST00000519538	255 nt	BASIC	2.57	□□□□□ -2
TAF1	P21675	AC007948.1-201	ENST00000581632	242 nt	TSL 5 BASIC	2.57	□□□□□ -2
TAF1	P21675	AL355877.2-201	ENST00000603670	358 nt	BASIC	2.57	□□□□□ -2
TAF1	P21675	MIR8070-201	ENST00000616510	88 nt	BASIC	2.57	□□□□□ -2
TAF1	P21675	LINC01592-202	ENST00000518540	2367 nt	TSL 2 BASIC	2.57	□□□□□ -2
TAF1	P21675	AC008163.1-205	ENST00000413944	4649 nt	TSL 1 (best) BASIC	2.57	□□□□□ -2
TAF1	P21675	AC080128.1-201	ENST00000474389	1917 nt	BASIC	2.57	□□□□□ -2
TAF1	P21675	LINC00836-202	ENST00000626230	1640 nt	TSL 2 BASIC	2.57	□□□□□ -2
TAF1	P21675	AL161668.1-201	ENST00000320322	358 nt	TSL 1 (best) BASIC	2.56	□□□□□ -2
TAF1	P21675	Y_RNA.445-201	ENST00000384168	102 nt	BASIC	2.56	□□□□□ -2
TAF1	P21675	RNU6-1222P-201	ENST00000384615	107 nt	BASIC	2.56	□□□□□ -2
TAF1	P21675	AC138623.1-201	ENST00000418060	216 nt	BASIC	2.56	□□□□□ -2
TAF1	P21675	AL136369.1-201	ENST00000437825	244 nt	TSL 5 BASIC	2.56	□□□□□ -2
TAF1	P21675	AL442638.1-201	ENST00000443359	237 nt	TSL 5 BASIC	2.56	□□□□□ -2
TAF1	P21675	snoU13.30-201	ENST00000458951	104 nt	BASIC	2.56	□□□□□ -2
TAF1	P21675	AC074033.2-201	ENST00000480669	535 nt	TSL 3 BASIC	2.56	□□□□□ -2
TAF1	P21675	AC027575.1-201	ENST00000481064	460 nt	BASIC	2.56	□□□□□ -2
TAF1	P21675	AC018437.1-201	ENST00000492214	406 nt	BASIC	2.56	□□□□□ -2
TAF1	P21675	RNU6-911P-201	ENST00000516523	104 nt	BASIC	2.56	□□□□□ -2
TAF1	P21675	SNORA43.2-201	ENST00000516652	128 nt	BASIC	2.56	□□□□□ -2
TAF1	P21675	SNORD59.2-201	ENST00000516873	68 nt	BASIC	2.56	□□□□□ -2
TAF1	P21675	TMCO5B-203	ENST00000529623	509 nt	TSL 4 BASIC	2.56	□□□□□ -2
TAF1	P21675	AC008115.2-201	ENST00000539988	241 nt	TSL 3 BASIC	2.56	□□□□□ -2
TAF1	P21675	AC093249.1-201	ENST00000567049	203 nt	BASIC	2.56	□□□□□ -2
TAF1	P21675	AC131274.4-201	ENST00000577879	398 nt	TSL 3 BASIC	2.56	□□□□□ -2
TAF1	P21675	AC011825.2-201	ENST00000583138	553 nt	TSL 4 BASIC	2.56	□□□□□ -2
TAF1	P21675	AC078795.3-201	ENST00000602913	472 nt	BASIC	2.56	□□□□□ -2
TAF1	P21675	SNRPGP19-201	ENST00000603826	189 nt	BASIC	2.56	□□□□□ -2
TAF1	P21675	AL670379.10-201	ENST00000604330	253 nt	BASIC	2.56	□□□□□ -2
TAF1	P21675	AL356157.2-201	ENST00000605122	111 nt	BASIC	2.56	□□□□□ -2
TAF1	P21675	AL670379.9-201	ENST00000605428	253 nt	BASIC	2.56	□□□□□ -2
TAF1	P21675	TP73-AS1.1-201	ENST00000611447	161 nt	BASIC	2.56	□□□□□ -2
TAF1	P21675	AC010297.1-201	ENST00000623948	149 nt	BASIC	2.56	□□□□□ -2
TAF1	P21675	NCBP1-205	ENST00000629069	249 nt	TSL 5 BASIC	2.56	□□□□□ -2
TAF1	P21675	MIR1302-1-201	ENST00000637932	143 nt	BASIC	2.56	□□□□□ -2
TAF1	P21675	MT-ND4-201	ENST00000361381	1378 nt	APPRIS P1 BASIC	2.56	□□□□□ -2
TAF1	P21675	PYGO1-201	ENST00000302000	8488 nt	TSL 1 (best) BASIC	2.56	□□□□□ -2
TAF1	P21675	DST-204	ENST00000361203	22431 nt	APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC	2.56	□□□□□ -2
TAF1	P21675	RNU6-1303P-201	ENST00000364841	107 nt	BASIC	2.56	□□□□□ -2
TAF1	P21675	Y_RNA.384-201	ENST00000383909	102 nt	BASIC	2.56	□□□□□ -2
TAF1	P21675	RNU6-842P-201	ENST00000384269	107 nt	BASIC	2.56	□□□□□ -2
TAF1	P21675	RNY4P36-201	ENST00000391116	96 nt	BASIC	2.56	□□□□□ -2
TAF1	P21675	MORN2-203	ENST00000409131	544 nt	TSL 5 BASIC	2.56	□□□□□ -2
TAF1	P21675	KCNJ6-AS1-201	ENST00000435001	357 nt	TSL 5 BASIC	2.56	□□□□□ -2
TAF1	P21675	AC007677.1-201	ENST00000445757	515 nt	BASIC	2.56	□□□□□ -2
TAF1	P21675	HMGN2P10-201	ENST00000448085	265 nt	BASIC	2.56	□□□□□ -2
TAF1	P21675	AC073901.1-201	ENST00000462471	408 nt	BASIC	2.56	□□□□□ -2
TAF1	P21675	ACA59.2-201	ENST00000517061	156 nt	BASIC	2.56	□□□□□ -2
TAF1	P21675	AC108449.1-202	ENST00000517632	478 nt	TSL 3 BASIC	2.56	□□□□□ -2
TAF1	P21675	HSPE1P20-201	ENST00000538133	289 nt	BASIC	2.56	□□□□□ -2
TAF1	P21675	AC007375.1-201	ENST00000554513	578 nt	BASIC	2.56	□□□□□ -2
TAF1	P21675	RPL23AP78-201	ENST00000599928	470 nt	BASIC	2.56	□□□□□ -2
TAF1	P21675	AL049779.4-201	ENST00000604500	156 nt	BASIC	2.56	□□□□□ -2
TAF1	P21675	AC018889.1-201	ENST00000605372	397 nt	BASIC	2.56	□□□□□ -2
TAF1	P21675	DLEU2_5.1-201	ENST00000615567	84 nt	BASIC	2.56	□□□□□ -2
TAF1	P21675	AC084781.2-201	ENST00000615568	161 nt	BASIC	2.56	□□□□□ -2
TAF1	P21675	AC098657.3-201	ENST00000620434	263 nt	BASIC	2.56	□□□□□ -2
TAF1	P21675	AC134503.1-201	ENST00000633048	54 nt	BASIC	2.56	□□□□□ -2
TAF1	P21675	ST7-AS2-206	ENST00000456577	1351 nt	TSL 1 (best) BASIC	2.55	□□□□□ -2
TAF1	P21675	AC006026.1-201	ENST00000444025	1803 nt	BASIC	2.55	□□□□□ -2
TAF1	P21675	SLC16A7-201	ENST00000261187	11777 nt	APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC	2.55	□□□□□ -2
TAF1	P21675	AK9-203	ENST00000368948	2478 nt	TSL 5 BASIC	2.55	□□□□□ -2
TAF1	P21675	Y_RNA.112-201	ENST00000363250	102 nt	BASIC	2.55	□□□□□ -2
TAF1	P21675	RNU6-1210P-201	ENST00000363775	107 nt	BASIC	2.55	□□□□□ -2
TAF1	P21675	Y_RNA.197-201	ENST00000364004	102 nt	BASIC	2.55	□□□□□ -2
TAF1	P21675	Y_RNA.813-201	ENST00000364639	102 nt	BASIC	2.55	□□□□□ -2
TAF1	P21675	RNU6-750P-201	ENST00000390946	107 nt	BASIC	2.55	□□□□□ -2
TAF1	P21675	RPL23AP95-201	ENST00000426806	265 nt	BASIC	2.55	□□□□□ -2
TAF1	P21675	AL445646.1-201	ENST00000431784	216 nt	BASIC	2.55	□□□□□ -2
TAF1	P21675	RPL23AP50-201	ENST00000434149	455 nt	BASIC	2.55	□□□□□ -2
TAF1	P21675	SNORD13-201	ENST00000459299	104 nt	BASIC	2.55	□□□□□ -2
TAF1	P21675	AC022039.1-201	ENST00000527110	488 nt	TSL 2 BASIC	2.55	□□□□□ -2
TAF1	P21675	APOOP3-201	ENST00000536787	586 nt	BASIC	2.55	□□□□□ -2
TAF1	P21675	AL136038.2-201	ENST00000553983	283 nt	TSL 3 BASIC	2.55	□□□□□ -2
TAF1	P21675	MIR4498-201	ENST00000577599	66 nt	BASIC	2.55	□□□□□ -2
TAF1	P21675	AC011890.2-201	ENST00000613393	294 nt	BASIC	2.55	□□□□□ -2
TAF1	P21675	HOXA11-AS1_4.1-201	ENST00000620901	233 nt	BASIC	2.55	□□□□□ -2
TAF1	P21675	AL161782.1-201	ENST00000622930	586 nt	TSL 3 BASIC	2.55	□□□□□ -2
TAF1	P21675	ABCA9-AS1-203	ENST00000627596	426 nt	TSL 5 BASIC	2.55	□□□□□ -2
TAF1	P21675	AC009975.1-201	ENST00000634588	2698 nt	TSL 5 BASIC	2.55	□□□□□ -2
TAF1	P21675	SI-201	ENST00000264382	6011 nt	APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC	2.54	□□□□□ -2
TAF1	P21675	SNORD56.5-201	ENST00000364281	72 nt	BASIC	2.54	□□□□□ -2
TAF1	P21675	RNU6-1141P-201	ENST00000364520	107 nt	BASIC	2.54	□□□□□ -2
TAF1	P21675	Y_RNA.315-201	ENST00000365117	102 nt	BASIC	2.54	□□□□□ -2
TAF1	P21675	Y_RNA.533-201	ENST00000384596	114 nt	BASIC	2.54	□□□□□ -2
TAF1	P21675	RNU6-370P-201	ENST00000411008	104 nt	BASIC	2.54	□□□□□ -2
TAF1	P21675	RPL23AP36-201	ENST00000413895	458 nt	BASIC	2.54	□□□□□ -2
TAF1	P21675	LINC02532-205	ENST00000430094	628 nt	TSL 5 BASIC	2.54	□□□□□ -2
TAF1	P21675	CEP57L1P1-201	ENST00000430943	1201 nt	BASIC	2.54	□□□□□ -2
TAF1	P21675	AL591501.1-201	ENST00000439992	495 nt	TSL 5 BASIC	2.54	□□□□□ -2
TAF1	P21675	AL357873.1-201	ENST00000449215	282 nt	TSL 3 BASIC	2.54	□□□□□ -2
TAF1	P21675	LINC02046-202	ENST00000481334	390 nt	TSL 3 BASIC	2.54	□□□□□ -2
TAF1	P21675	RPS27P26-201	ENST00000494583	239 nt	BASIC	2.54	□□□□□ -2

Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 169.8 ms