Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
MRPL28Q13084 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC1.46□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.45□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 AP000770.2-201ENST00000623694 100 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC1.44□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC1.44□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
MRPL28Q13084 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
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