Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y3

Homer1, Homer protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer1Q9Z2Y3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Homer1Q9Z2Y3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms