Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2I4

Robo3, Roundabout homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo3Q9Z2I4 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Robo3Q9Z2I4 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Robo3Q9Z2I4 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Robo3Q9Z2I4 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Robo3Q9Z2I4 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Robo3Q9Z2I4 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Robo3Q9Z2I4 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Robo3Q9Z2I4 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Robo3Q9Z2I4 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Robo3Q9Z2I4 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Robo3Q9Z2I4 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Robo3Q9Z2I4 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Robo3Q9Z2I4 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Robo3Q9Z2I4 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Robo3Q9Z2I4 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Robo3Q9Z2I4 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Robo3Q9Z2I4 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Robo3Q9Z2I4 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Robo3Q9Z2I4 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Robo3Q9Z2I4 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Robo3Q9Z2I4 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Robo3Q9Z2I4 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Robo3Q9Z2I4 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Robo3Q9Z2I4 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Robo3Q9Z2I4 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Robo3Q9Z2I4 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Robo3Q9Z2I4 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Robo3Q9Z2I4 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Robo3Q9Z2I4 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Robo3Q9Z2I4 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Robo3Q9Z2I4 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Robo3Q9Z2I4 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Robo3Q9Z2I4 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Robo3Q9Z2I4 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Robo3Q9Z2I4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Robo3Q9Z2I4 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Robo3Q9Z2I4 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Robo3Q9Z2I4 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Robo3Q9Z2I4 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Robo3Q9Z2I4 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Robo3Q9Z2I4 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Robo3Q9Z2I4 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Robo3Q9Z2I4 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Robo3Q9Z2I4 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Robo3Q9Z2I4 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Robo3Q9Z2I4 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Robo3Q9Z2I4 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Robo3Q9Z2I4 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Robo3Q9Z2I4 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Robo3Q9Z2I4 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Robo3Q9Z2I4 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Robo3Q9Z2I4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Robo3Q9Z2I4 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Robo3Q9Z2I4 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Robo3Q9Z2I4 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Robo3Q9Z2I4 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Robo3Q9Z2I4 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Robo3Q9Z2I4 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Robo3Q9Z2I4 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Robo3Q9Z2I4 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Robo3Q9Z2I4 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Robo3Q9Z2I4 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Robo3Q9Z2I4 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Robo3Q9Z2I4 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Robo3Q9Z2I4 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Robo3Q9Z2I4 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Robo3Q9Z2I4 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Robo3Q9Z2I4 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Robo3Q9Z2I4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Robo3Q9Z2I4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Robo3Q9Z2I4 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Robo3Q9Z2I4 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Robo3Q9Z2I4 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Robo3Q9Z2I4 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Robo3Q9Z2I4 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Robo3Q9Z2I4 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Robo3Q9Z2I4 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Robo3Q9Z2I4 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Robo3Q9Z2I4 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Robo3Q9Z2I4 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms