Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms