Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lgr5Q9Z1P4 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lgr5Q9Z1P4 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lgr5Q9Z1P4 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lgr5Q9Z1P4 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lgr5Q9Z1P4 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lgr5Q9Z1P4 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Lgr5Q9Z1P4 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Lgr5Q9Z1P4 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lgr5Q9Z1P4 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lgr5Q9Z1P4 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lgr5Q9Z1P4 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lgr5Q9Z1P4 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lgr5Q9Z1P4 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lgr5Q9Z1P4 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lgr5Q9Z1P4 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lgr5Q9Z1P4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lgr5Q9Z1P4 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Lgr5Q9Z1P4 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lgr5Q9Z1P4 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lgr5Q9Z1P4 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lgr5Q9Z1P4 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lgr5Q9Z1P4 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lgr5Q9Z1P4 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lgr5Q9Z1P4 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lgr5Q9Z1P4 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lgr5Q9Z1P4 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lgr5Q9Z1P4 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lgr5Q9Z1P4 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lgr5Q9Z1P4 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Lgr5Q9Z1P4 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lgr5Q9Z1P4 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lgr5Q9Z1P4 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lgr5Q9Z1P4 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lgr5Q9Z1P4 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lgr5Q9Z1P4 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lgr5Q9Z1P4 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lgr5Q9Z1P4 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lgr5Q9Z1P4 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms