Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N6

Sfrp4, Secreted frizzled-related sequence protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp4Q9Z1N6 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sfrp4Q9Z1N6 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sfrp4Q9Z1N6 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sfrp4Q9Z1N6 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sfrp4Q9Z1N6 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sfrp4Q9Z1N6 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sfrp4Q9Z1N6 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sfrp4Q9Z1N6 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sfrp4Q9Z1N6 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sfrp4Q9Z1N6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sfrp4Q9Z1N6 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sfrp4Q9Z1N6 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sfrp4Q9Z1N6 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sfrp4Q9Z1N6 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sfrp4Q9Z1N6 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sfrp4Q9Z1N6 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sfrp4Q9Z1N6 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sfrp4Q9Z1N6 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sfrp4Q9Z1N6 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sfrp4Q9Z1N6 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sfrp4Q9Z1N6 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sfrp4Q9Z1N6 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sfrp4Q9Z1N6 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sfrp4Q9Z1N6 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sfrp4Q9Z1N6 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sfrp4Q9Z1N6 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sfrp4Q9Z1N6 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sfrp4Q9Z1N6 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sfrp4Q9Z1N6 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sfrp4Q9Z1N6 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sfrp4Q9Z1N6 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sfrp4Q9Z1N6 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sfrp4Q9Z1N6 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sfrp4Q9Z1N6 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sfrp4Q9Z1N6 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sfrp4Q9Z1N6 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sfrp4Q9Z1N6 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sfrp4Q9Z1N6 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sfrp4Q9Z1N6 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sfrp4Q9Z1N6 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sfrp4Q9Z1N6 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sfrp4Q9Z1N6 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms