Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W1

Ngfr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgfrQ9Z0W1 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
NgfrQ9Z0W1 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NgfrQ9Z0W1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NgfrQ9Z0W1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NgfrQ9Z0W1 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NgfrQ9Z0W1 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NgfrQ9Z0W1 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NgfrQ9Z0W1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NgfrQ9Z0W1 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NgfrQ9Z0W1 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NgfrQ9Z0W1 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NgfrQ9Z0W1 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NgfrQ9Z0W1 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NgfrQ9Z0W1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NgfrQ9Z0W1 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NgfrQ9Z0W1 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NgfrQ9Z0W1 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NgfrQ9Z0W1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NgfrQ9Z0W1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NgfrQ9Z0W1 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NgfrQ9Z0W1 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
NgfrQ9Z0W1 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NgfrQ9Z0W1 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NgfrQ9Z0W1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NgfrQ9Z0W1 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NgfrQ9Z0W1 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NgfrQ9Z0W1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms