Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E3

Aire, Autoimmune regulator, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AireQ9Z0E3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
AireQ9Z0E3 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.1
AireQ9Z0E3 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
AireQ9Z0E3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
AireQ9Z0E3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
AireQ9Z0E3 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
AireQ9Z0E3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
AireQ9Z0E3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
AireQ9Z0E3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
AireQ9Z0E3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
AireQ9Z0E3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
AireQ9Z0E3 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
AireQ9Z0E3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
AireQ9Z0E3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
AireQ9Z0E3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
AireQ9Z0E3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
AireQ9Z0E3 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms