Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVE8

Pacsin2, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin2Q9WVE8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms