Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV89

Stxbp4, Syntaxin-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp4Q9WV89 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stxbp4Q9WV89 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stxbp4Q9WV89 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stxbp4Q9WV89 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stxbp4Q9WV89 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stxbp4Q9WV89 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stxbp4Q9WV89 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stxbp4Q9WV89 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stxbp4Q9WV89 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Stxbp4Q9WV89 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stxbp4Q9WV89 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Stxbp4Q9WV89 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stxbp4Q9WV89 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stxbp4Q9WV89 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stxbp4Q9WV89 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stxbp4Q9WV89 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Stxbp4Q9WV89 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Stxbp4Q9WV89 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Stxbp4Q9WV89 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Stxbp4Q9WV89 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Stxbp4Q9WV89 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Stxbp4Q9WV89 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Stxbp4Q9WV89 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Stxbp4Q9WV89 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Stxbp4Q9WV89 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stxbp4Q9WV89 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stxbp4Q9WV89 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stxbp4Q9WV89 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Stxbp4Q9WV89 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stxbp4Q9WV89 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stxbp4Q9WV89 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stxbp4Q9WV89 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stxbp4Q9WV89 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stxbp4Q9WV89 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stxbp4Q9WV89 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stxbp4Q9WV89 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stxbp4Q9WV89 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stxbp4Q9WV89 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stxbp4Q9WV89 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stxbp4Q9WV89 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stxbp4Q9WV89 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stxbp4Q9WV89 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stxbp4Q9WV89 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stxbp4Q9WV89 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stxbp4Q9WV89 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stxbp4Q9WV89 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stxbp4Q9WV89 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stxbp4Q9WV89 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stxbp4Q9WV89 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stxbp4Q9WV89 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stxbp4Q9WV89 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Stxbp4Q9WV89 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stxbp4Q9WV89 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stxbp4Q9WV89 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stxbp4Q9WV89 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stxbp4Q9WV89 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stxbp4Q9WV89 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stxbp4Q9WV89 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stxbp4Q9WV89 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stxbp4Q9WV89 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stxbp4Q9WV89 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stxbp4Q9WV89 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stxbp4Q9WV89 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stxbp4Q9WV89 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stxbp4Q9WV89 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stxbp4Q9WV89 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stxbp4Q9WV89 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stxbp4Q9WV89 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stxbp4Q9WV89 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stxbp4Q9WV89 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stxbp4Q9WV89 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stxbp4Q9WV89 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stxbp4Q9WV89 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stxbp4Q9WV89 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stxbp4Q9WV89 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stxbp4Q9WV89 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stxbp4Q9WV89 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stxbp4Q9WV89 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stxbp4Q9WV89 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Stxbp4Q9WV89 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stxbp4Q9WV89 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stxbp4Q9WV89 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stxbp4Q9WV89 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stxbp4Q9WV89 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stxbp4Q9WV89 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stxbp4Q9WV89 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stxbp4Q9WV89 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stxbp4Q9WV89 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stxbp4Q9WV89 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stxbp4Q9WV89 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stxbp4Q9WV89 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stxbp4Q9WV89 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stxbp4Q9WV89 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stxbp4Q9WV89 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stxbp4Q9WV89 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stxbp4Q9WV89 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stxbp4Q9WV89 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Stxbp4Q9WV89 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stxbp4Q9WV89 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stxbp4Q9WV89 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms