Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUU8

Tnip1, TNFAIP3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip1Q9WUU8 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnip1Q9WUU8 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms