Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUB0

Rbck1, RanBP-type and C3HC4-type zinc finger-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbck1Q9WUB0 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbck1Q9WUB0 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbck1Q9WUB0 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbck1Q9WUB0 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbck1Q9WUB0 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbck1Q9WUB0 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbck1Q9WUB0 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbck1Q9WUB0 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbck1Q9WUB0 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbck1Q9WUB0 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbck1Q9WUB0 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbck1Q9WUB0 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbck1Q9WUB0 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbck1Q9WUB0 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbck1Q9WUB0 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbck1Q9WUB0 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbck1Q9WUB0 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbck1Q9WUB0 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbck1Q9WUB0 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbck1Q9WUB0 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbck1Q9WUB0 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbck1Q9WUB0 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbck1Q9WUB0 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbck1Q9WUB0 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbck1Q9WUB0 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbck1Q9WUB0 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbck1Q9WUB0 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbck1Q9WUB0 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbck1Q9WUB0 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbck1Q9WUB0 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbck1Q9WUB0 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbck1Q9WUB0 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbck1Q9WUB0 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbck1Q9WUB0 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbck1Q9WUB0 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbck1Q9WUB0 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbck1Q9WUB0 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbck1Q9WUB0 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbck1Q9WUB0 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbck1Q9WUB0 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbck1Q9WUB0 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbck1Q9WUB0 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbck1Q9WUB0 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbck1Q9WUB0 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbck1Q9WUB0 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbck1Q9WUB0 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbck1Q9WUB0 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbck1Q9WUB0 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbck1Q9WUB0 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbck1Q9WUB0 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbck1Q9WUB0 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbck1Q9WUB0 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbck1Q9WUB0 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbck1Q9WUB0 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbck1Q9WUB0 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbck1Q9WUB0 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbck1Q9WUB0 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbck1Q9WUB0 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbck1Q9WUB0 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbck1Q9WUB0 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbck1Q9WUB0 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbck1Q9WUB0 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbck1Q9WUB0 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbck1Q9WUB0 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbck1Q9WUB0 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbck1Q9WUB0 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbck1Q9WUB0 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbck1Q9WUB0 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbck1Q9WUB0 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbck1Q9WUB0 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbck1Q9WUB0 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbck1Q9WUB0 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbck1Q9WUB0 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbck1Q9WUB0 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbck1Q9WUB0 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbck1Q9WUB0 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbck1Q9WUB0 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbck1Q9WUB0 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbck1Q9WUB0 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbck1Q9WUB0 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbck1Q9WUB0 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbck1Q9WUB0 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbck1Q9WUB0 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbck1Q9WUB0 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbck1Q9WUB0 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbck1Q9WUB0 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbck1Q9WUB0 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbck1Q9WUB0 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbck1Q9WUB0 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbck1Q9WUB0 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbck1Q9WUB0 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbck1Q9WUB0 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbck1Q9WUB0 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbck1Q9WUB0 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbck1Q9WUB0 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbck1Q9WUB0 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Rbck1Q9WUB0 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rbck1Q9WUB0 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rbck1Q9WUB0 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbck1Q9WUB0 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms