Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU62

Incenp, Inner centromere protein, mousemouse

Predictions only

Length 880 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IncenpQ9WU62 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IncenpQ9WU62 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IncenpQ9WU62 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IncenpQ9WU62 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IncenpQ9WU62 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IncenpQ9WU62 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IncenpQ9WU62 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IncenpQ9WU62 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IncenpQ9WU62 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IncenpQ9WU62 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IncenpQ9WU62 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IncenpQ9WU62 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
IncenpQ9WU62 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IncenpQ9WU62 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IncenpQ9WU62 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IncenpQ9WU62 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IncenpQ9WU62 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IncenpQ9WU62 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IncenpQ9WU62 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IncenpQ9WU62 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IncenpQ9WU62 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IncenpQ9WU62 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
IncenpQ9WU62 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
IncenpQ9WU62 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
IncenpQ9WU62 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IncenpQ9WU62 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
IncenpQ9WU62 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IncenpQ9WU62 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IncenpQ9WU62 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IncenpQ9WU62 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IncenpQ9WU62 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IncenpQ9WU62 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IncenpQ9WU62 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IncenpQ9WU62 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IncenpQ9WU62 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IncenpQ9WU62 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IncenpQ9WU62 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IncenpQ9WU62 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IncenpQ9WU62 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IncenpQ9WU62 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IncenpQ9WU62 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IncenpQ9WU62 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IncenpQ9WU62 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IncenpQ9WU62 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IncenpQ9WU62 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IncenpQ9WU62 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IncenpQ9WU62 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
IncenpQ9WU62 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IncenpQ9WU62 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IncenpQ9WU62 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IncenpQ9WU62 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IncenpQ9WU62 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IncenpQ9WU62 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IncenpQ9WU62 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
IncenpQ9WU62 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
IncenpQ9WU62 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IncenpQ9WU62 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IncenpQ9WU62 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IncenpQ9WU62 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IncenpQ9WU62 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IncenpQ9WU62 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IncenpQ9WU62 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
IncenpQ9WU62 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IncenpQ9WU62 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IncenpQ9WU62 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IncenpQ9WU62 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IncenpQ9WU62 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IncenpQ9WU62 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IncenpQ9WU62 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IncenpQ9WU62 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IncenpQ9WU62 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IncenpQ9WU62 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IncenpQ9WU62 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IncenpQ9WU62 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
IncenpQ9WU62 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
IncenpQ9WU62 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
IncenpQ9WU62 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
IncenpQ9WU62 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IncenpQ9WU62 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IncenpQ9WU62 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IncenpQ9WU62 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IncenpQ9WU62 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IncenpQ9WU62 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IncenpQ9WU62 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IncenpQ9WU62 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IncenpQ9WU62 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
IncenpQ9WU62 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IncenpQ9WU62 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IncenpQ9WU62 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
IncenpQ9WU62 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
IncenpQ9WU62 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IncenpQ9WU62 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IncenpQ9WU62 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IncenpQ9WU62 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IncenpQ9WU62 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IncenpQ9WU62 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IncenpQ9WU62 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IncenpQ9WU62 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IncenpQ9WU62 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IncenpQ9WU62 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms