Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Trpc2Q9R244 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trpc2Q9R244 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms