Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G8

Nrk, Nik-related protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrkQ9R0G8 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NrkQ9R0G8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NrkQ9R0G8 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NrkQ9R0G8 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NrkQ9R0G8 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NrkQ9R0G8 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NrkQ9R0G8 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NrkQ9R0G8 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NrkQ9R0G8 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NrkQ9R0G8 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NrkQ9R0G8 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NrkQ9R0G8 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NrkQ9R0G8 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NrkQ9R0G8 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NrkQ9R0G8 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NrkQ9R0G8 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NrkQ9R0G8 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NrkQ9R0G8 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NrkQ9R0G8 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NrkQ9R0G8 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NrkQ9R0G8 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NrkQ9R0G8 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NrkQ9R0G8 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NrkQ9R0G8 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NrkQ9R0G8 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NrkQ9R0G8 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NrkQ9R0G8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NrkQ9R0G8 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NrkQ9R0G8 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NrkQ9R0G8 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NrkQ9R0G8 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NrkQ9R0G8 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NrkQ9R0G8 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NrkQ9R0G8 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NrkQ9R0G8 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NrkQ9R0G8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NrkQ9R0G8 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NrkQ9R0G8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NrkQ9R0G8 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NrkQ9R0G8 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NrkQ9R0G8 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NrkQ9R0G8 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NrkQ9R0G8 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NrkQ9R0G8 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NrkQ9R0G8 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NrkQ9R0G8 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NrkQ9R0G8 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NrkQ9R0G8 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NrkQ9R0G8 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NrkQ9R0G8 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NrkQ9R0G8 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NrkQ9R0G8 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NrkQ9R0G8 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NrkQ9R0G8 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NrkQ9R0G8 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NrkQ9R0G8 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NrkQ9R0G8 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NrkQ9R0G8 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NrkQ9R0G8 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NrkQ9R0G8 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NrkQ9R0G8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NrkQ9R0G8 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NrkQ9R0G8 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NrkQ9R0G8 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NrkQ9R0G8 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NrkQ9R0G8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NrkQ9R0G8 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NrkQ9R0G8 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NrkQ9R0G8 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NrkQ9R0G8 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NrkQ9R0G8 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NrkQ9R0G8 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NrkQ9R0G8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NrkQ9R0G8 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NrkQ9R0G8 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NrkQ9R0G8 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NrkQ9R0G8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NrkQ9R0G8 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NrkQ9R0G8 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NrkQ9R0G8 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NrkQ9R0G8 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NrkQ9R0G8 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NrkQ9R0G8 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NrkQ9R0G8 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NrkQ9R0G8 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NrkQ9R0G8 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NrkQ9R0G8 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NrkQ9R0G8 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NrkQ9R0G8 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NrkQ9R0G8 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NrkQ9R0G8 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NrkQ9R0G8 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NrkQ9R0G8 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NrkQ9R0G8 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NrkQ9R0G8 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NrkQ9R0G8 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NrkQ9R0G8 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NrkQ9R0G8 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NrkQ9R0G8 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NrkQ9R0G8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms