Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Plod3Q9R0E1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Plod3Q9R0E1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Plod3Q9R0E1 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Plod3Q9R0E1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Plod3Q9R0E1 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Plod3Q9R0E1 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Plod3Q9R0E1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Plod3Q9R0E1 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Plod3Q9R0E1 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Plod3Q9R0E1 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Plod3Q9R0E1 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Plod3Q9R0E1 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Plod3Q9R0E1 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Plod3Q9R0E1 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Plod3Q9R0E1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Plod3Q9R0E1 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Plod3Q9R0E1 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Plod3Q9R0E1 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Plod3Q9R0E1 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Plod3Q9R0E1 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Plod3Q9R0E1 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Plod3Q9R0E1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Plod3Q9R0E1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Plod3Q9R0E1 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Plod3Q9R0E1 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Plod3Q9R0E1 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Plod3Q9R0E1 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Plod3Q9R0E1 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Plod3Q9R0E1 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Plod3Q9R0E1 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Plod3Q9R0E1 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Plod3Q9R0E1 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Plod3Q9R0E1 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Plod3Q9R0E1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Plod3Q9R0E1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Plod3Q9R0E1 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Plod3Q9R0E1 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Plod3Q9R0E1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Plod3Q9R0E1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Plod3Q9R0E1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Plod3Q9R0E1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Plod3Q9R0E1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Plod3Q9R0E1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Plod3Q9R0E1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Plod3Q9R0E1 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Plod3Q9R0E1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Plod3Q9R0E1 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Plod3Q9R0E1 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms