Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Lamc3Q9R0B6 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Lamc3Q9R0B6 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Lamc3Q9R0B6 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Lamc3Q9R0B6 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Lamc3Q9R0B6 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Lamc3Q9R0B6 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Lamc3Q9R0B6 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Lamc3Q9R0B6 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Lamc3Q9R0B6 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Lamc3Q9R0B6 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Lamc3Q9R0B6 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Lamc3Q9R0B6 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Lamc3Q9R0B6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Lamc3Q9R0B6 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Lamc3Q9R0B6 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Lamc3Q9R0B6 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Lamc3Q9R0B6 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Lamc3Q9R0B6 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lamc3Q9R0B6 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lamc3Q9R0B6 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lamc3Q9R0B6 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lamc3Q9R0B6 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lamc3Q9R0B6 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lamc3Q9R0B6 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lamc3Q9R0B6 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lamc3Q9R0B6 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lamc3Q9R0B6 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Lamc3Q9R0B6 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lamc3Q9R0B6 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lamc3Q9R0B6 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lamc3Q9R0B6 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lamc3Q9R0B6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lamc3Q9R0B6 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lamc3Q9R0B6 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lamc3Q9R0B6 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lamc3Q9R0B6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lamc3Q9R0B6 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lamc3Q9R0B6 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
Lamc3Q9R0B6 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
Lamc3Q9R0B6 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Lamc3Q9R0B6 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Lamc3Q9R0B6 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Lamc3Q9R0B6 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Lamc3Q9R0B6 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Lamc3Q9R0B6 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Lamc3Q9R0B6 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lamc3Q9R0B6 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Lamc3Q9R0B6 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lamc3Q9R0B6 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lamc3Q9R0B6 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lamc3Q9R0B6 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lamc3Q9R0B6 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lamc3Q9R0B6 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lamc3Q9R0B6 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lamc3Q9R0B6 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Lamc3Q9R0B6 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lamc3Q9R0B6 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lamc3Q9R0B6 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lamc3Q9R0B6 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lamc3Q9R0B6 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lamc3Q9R0B6 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lamc3Q9R0B6 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lamc3Q9R0B6 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lamc3Q9R0B6 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lamc3Q9R0B6 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lamc3Q9R0B6 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lamc3Q9R0B6 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Lamc3Q9R0B6 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lamc3Q9R0B6 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lamc3Q9R0B6 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lamc3Q9R0B6 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lamc3Q9R0B6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lamc3Q9R0B6 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lamc3Q9R0B6 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lamc3Q9R0B6 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lamc3Q9R0B6 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lamc3Q9R0B6 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lamc3Q9R0B6 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lamc3Q9R0B6 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Lamc3Q9R0B6 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Lamc3Q9R0B6 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lamc3Q9R0B6 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lamc3Q9R0B6 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Lamc3Q9R0B6 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lamc3Q9R0B6 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lamc3Q9R0B6 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lamc3Q9R0B6 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lamc3Q9R0B6 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lamc3Q9R0B6 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lamc3Q9R0B6 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lamc3Q9R0B6 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lamc3Q9R0B6 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lamc3Q9R0B6 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lamc3Q9R0B6 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lamc3Q9R0B6 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lamc3Q9R0B6 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lamc3Q9R0B6 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lamc3Q9R0B6 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lamc3Q9R0B6 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms