Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms