Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZC1

Trpc3, Short transient receptor potential channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc3Q9QZC1 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpc3Q9QZC1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc3Q9QZC1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc3Q9QZC1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc3Q9QZC1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc3Q9QZC1 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc3Q9QZC1 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc3Q9QZC1 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc3Q9QZC1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc3Q9QZC1 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc3Q9QZC1 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc3Q9QZC1 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc3Q9QZC1 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc3Q9QZC1 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc3Q9QZC1 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc3Q9QZC1 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc3Q9QZC1 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc3Q9QZC1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc3Q9QZC1 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc3Q9QZC1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc3Q9QZC1 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc3Q9QZC1 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc3Q9QZC1 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc3Q9QZC1 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc3Q9QZC1 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc3Q9QZC1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc3Q9QZC1 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc3Q9QZC1 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc3Q9QZC1 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc3Q9QZC1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc3Q9QZC1 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpc3Q9QZC1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpc3Q9QZC1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpc3Q9QZC1 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpc3Q9QZC1 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpc3Q9QZC1 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpc3Q9QZC1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpc3Q9QZC1 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpc3Q9QZC1 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpc3Q9QZC1 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpc3Q9QZC1 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpc3Q9QZC1 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpc3Q9QZC1 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpc3Q9QZC1 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpc3Q9QZC1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpc3Q9QZC1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpc3Q9QZC1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpc3Q9QZC1 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpc3Q9QZC1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpc3Q9QZC1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpc3Q9QZC1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpc3Q9QZC1 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpc3Q9QZC1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trpc3Q9QZC1 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trpc3Q9QZC1 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trpc3Q9QZC1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trpc3Q9QZC1 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trpc3Q9QZC1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trpc3Q9QZC1 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trpc3Q9QZC1 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trpc3Q9QZC1 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trpc3Q9QZC1 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trpc3Q9QZC1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trpc3Q9QZC1 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trpc3Q9QZC1 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trpc3Q9QZC1 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trpc3Q9QZC1 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Trpc3Q9QZC1 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trpc3Q9QZC1 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trpc3Q9QZC1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trpc3Q9QZC1 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trpc3Q9QZC1 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trpc3Q9QZC1 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trpc3Q9QZC1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trpc3Q9QZC1 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trpc3Q9QZC1 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trpc3Q9QZC1 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trpc3Q9QZC1 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trpc3Q9QZC1 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trpc3Q9QZC1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trpc3Q9QZC1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trpc3Q9QZC1 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trpc3Q9QZC1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trpc3Q9QZC1 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trpc3Q9QZC1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trpc3Q9QZC1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trpc3Q9QZC1 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trpc3Q9QZC1 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trpc3Q9QZC1 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trpc3Q9QZC1 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trpc3Q9QZC1 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trpc3Q9QZC1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trpc3Q9QZC1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trpc3Q9QZC1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms