Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn8Q9QZ49 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn8Q9QZ49 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn8Q9QZ49 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn8Q9QZ49 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn8Q9QZ49 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn8Q9QZ49 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn8Q9QZ49 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn8Q9QZ49 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn8Q9QZ49 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn8Q9QZ49 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn8Q9QZ49 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn8Q9QZ49 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn8Q9QZ49 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn8Q9QZ49 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn8Q9QZ49 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn8Q9QZ49 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn8Q9QZ49 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn8Q9QZ49 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn8Q9QZ49 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn8Q9QZ49 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn8Q9QZ49 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn8Q9QZ49 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn8Q9QZ49 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn8Q9QZ49 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn8Q9QZ49 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn8Q9QZ49 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn8Q9QZ49 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn8Q9QZ49 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn8Q9QZ49 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn8Q9QZ49 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn8Q9QZ49 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn8Q9QZ49 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn8Q9QZ49 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn8Q9QZ49 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn8Q9QZ49 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn8Q9QZ49 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn8Q9QZ49 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn8Q9QZ49 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn8Q9QZ49 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn8Q9QZ49 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn8Q9QZ49 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn8Q9QZ49 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn8Q9QZ49 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn8Q9QZ49 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn8Q9QZ49 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn8Q9QZ49 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn8Q9QZ49 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn8Q9QZ49 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn8Q9QZ49 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn8Q9QZ49 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn8Q9QZ49 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn8Q9QZ49 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn8Q9QZ49 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn8Q9QZ49 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn8Q9QZ49 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn8Q9QZ49 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn8Q9QZ49 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn8Q9QZ49 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn8Q9QZ49 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn8Q9QZ49 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn8Q9QZ49 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn8Q9QZ49 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn8Q9QZ49 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn8Q9QZ49 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn8Q9QZ49 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn8Q9QZ49 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn8Q9QZ49 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn8Q9QZ49 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn8Q9QZ49 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubxn8Q9QZ49 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubxn8Q9QZ49 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubxn8Q9QZ49 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubxn8Q9QZ49 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubxn8Q9QZ49 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubxn8Q9QZ49 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubxn8Q9QZ49 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubxn8Q9QZ49 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubxn8Q9QZ49 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubxn8Q9QZ49 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubxn8Q9QZ49 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubxn8Q9QZ49 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubxn8Q9QZ49 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubxn8Q9QZ49 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubxn8Q9QZ49 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubxn8Q9QZ49 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms