Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

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Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Six6Q9QZ28 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
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